Za njega se slobodno može reći da nije imao sportske sreće i da su ga povrede uništile te da zbog njih nije postao mnogo kvalitetniji igrač nego je to sada.
Holger Badštuber rođen je 13. marta 1989. godine u Memingenu pokraj Minhena i trenutno je član Štutgarta. Fudbalom se počeo baviti u lokalnom Rot a der Rotu da bi 2000. stigao u omladinsku školu Štutgarta koju je naspustio nakon dvije godine i postao član mladog tima Bajerna. Igrao je za rezervni tim Bavaraca od 2007. do 2009. kada je prekomandovan u prvim tim slavnog kluba. Za B ekipu odigrao je 56 mečeva i dao sedam golova što je dobar učinak za jednog štopera. Zajedno sa saigračem Tomasom Milerom presjedio je dosta utakmica prvog tima tokom sezone 2008/09 dok je debi imao protiv Hofenhajma da bi prvi gol dao protiv velikog rivala, dortmundske Borusije 4. decembra 2009. godine.
Po potrebi je igrao i na poziciji lijevog beka i vrlo brzo impresinirao je trenera pa je postao standardni član zadnje linije Bajerna. Uprava ekipe 4. februara 2010. objavila je da je potpisao novi ugovor kojim se obavezao na četverogodišnju vjernost. Imao je problema sa trenerom Luisom van Galom tokom sezone 2010/11 koji ga često znao kritikovati zbog lošijih partija, iako mu je pružao priliku da igra te ga nije ostavljao na klupi. Povratkom Jupa Hajnkesa na klupu Badšuber je sa pozicije lijevog beka vraćen na štopera i posebno dobro u odbrani se slagao sa Džeromom Boatengom koji je prebačan na lijevog beka.
Novo produženje ugovora potpisao je 3. februara 2013. i trebalo je da ostane u klubu do 2017. godine, ali je godinu prije toga doživio tešku povredu ligamenata koljena i o povratku na teren ponovo je doživio tešku povredu koja ga je odvojila od fudbala za cijelu 2013/14 sezonu. Samo nekoliko sedmica nakon što se oporavio ponovo se povrijedio pa je čak 594 dana proveo van terena, a novu, četvrtu povredu imao je 13. septembra 2014. i zbog nje nije igrao do kraja godine. Vratio se u tim sredinom februara i izborio je mjesto u timu kojeg je trenirao Pepe Gvardiolada da bi 11. marta 2015. postigao gol u Ligi šampiona protiv Šahtjora iz Donjecka što je bio njegov prvi pogodak nakon 2009. godine kao i prvi start u LŠ poslije susreta sa Valensijom 20. novembra 2012.
Nove loše vijesti stigle su 23. aprila 2015. kada je objavljeno da je pokidao butni mišić što je za njega bio kraj sezone. Pozajmljen je Šalkeu 10. januara 2017. do kraja sezone dok je istog dana sa Bajernom potpisao produžetak saradnje do 2018. Za ekipu iz Gelzenkirhena odigrao je svega deset mečeva i nije se upisao među strijelce, a prošle godine interesovanje za njega pokazao je Štutgart tako da se vratio u tim gdje je igrao kao dječak. Ugovor je potpisan 4. avgsuta, a među “švabe” je stigao kao slobodan igrač nakon što su Bavarci sa njim raskinuli saradnju, a odigrao je 119 mečeva i samo jednom se upisao među strijelce. Uprava novog kluba bila je zadovljna njima pa je 10. juna ove godine produžila ugovor sa njim do juna 2021.
Bio je član U19, U20 u U21 reprezentacije Njemačke da bi debi u seniorskom timu imao 29. maja 2010. kada je na prijateljskom meču sa Mađarskom zamijenio Arnea Fridriha, a na idućoj prijateljskoj utakmici sa BiH bio starter. Nastupio je na Svjetskom prvenstvu u Južnoj Africi iste godine gdje je stigao do bronzane medalje da bi se tokom kvalifikacija za Evropsko prvenstvo 2012. nametnu kao bitan igrač u odbrani, a poslije EP u Ukrajini i Poljskoj prvi nastup imao je tek 2015. kada se oporavio od povrede. Za “pancere” je odigrao 31 meč i dao jedan gol.